Při studiu mikroflóry slepého střeva kura domácího je důležité si uvědomit rozdíly mezi mikroflórou kuřat v prvních týdnech života a dospělých slepic, a pak mezi různými typy dospělých jedinců. Přestože nelze ignorovat komerční produkci, mikroflóru kuřat ve výkrmu nelze považovat za typickou pro kura domácího. K ustavení mikroflóry dospělého typu v komerční produkci je potřeba delšího času (podrobnosti zde). Kuřata lze osídlit mikroflórou dospělého typu od prvních dnů života (podrobnosti např. zde, zde nebo zde). Pro výběr baktérií vhodných k osídlování kuřat je žádoucí porovnat mikroflóru co nejširšího spektra kura domácího (podrobnosti např. zde) slepic z komerční produkce, zájmových chovů nebo různých plemen vystavovaných např. v Zooparku Vyškov.
